Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms