Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms