Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm6899Q3USS0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm6899Q3USS0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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