Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5460Q3UQ97 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm5460Q3UQ97 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5460Q3UQ97 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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