Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxosQ3UL53 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxosQ3UL53 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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