Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpr55Q3UJF0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpr55Q3UJF0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms