Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp19Q3UJD6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms