Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trafd1Q3UDK1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms