Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3U595 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3U595 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3U595 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms