Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srebf2Q3U1N2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms