Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms