Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hhla1Q3TYV2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hhla1Q3TYV2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hhla1Q3TYV2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hhla1Q3TYV2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hhla1Q3TYV2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hhla1Q3TYV2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hhla1Q3TYV2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms