Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
InipQ3TXT3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms