Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TTJ4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms