Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc102aQ3TMW1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms