Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp39Q3TIX9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp39Q3TIX9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp39Q3TIX9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp39Q3TIX9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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