Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2f1Q3THK3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms