Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prr27Q3SYJ2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms