Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl9Q32KG4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms