Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms