Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cd300lgQ1ERP8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms