Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpusd2Q149F1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms