Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Traf3ip1Q149C2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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