Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Spatc1Q148B6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms