Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gata4Q08369 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms