Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tgm3Q08189 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgm3Q08189 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms