Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Cnn1Q08091 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Cnn1Q08091 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Cnn1Q08091 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Cnn1Q08091 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn1Q08091 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms