Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pou6f1Q07916 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou6f1Q07916 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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