Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cntn3Q07409 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntn3Q07409 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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