Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah2Q06986 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms