Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms