Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms