Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgfr4Q03142 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms