Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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NfiaQ02780 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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NfiaQ02780 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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NfiaQ02780 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NfiaQ02780 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NfiaQ02780 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NfiaQ02780 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfiaQ02780 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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