Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2aQ01320 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms