Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EgfrQ01279 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms