Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms