Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde1bQ01065 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde1bQ01065 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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