Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms