Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfaQ00731 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfaQ00731 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfaQ00731 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfaQ00731 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfaQ00731 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms