Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GabpaQ00422 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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