Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
rp9P97762 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
rp9P97762 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
rp9P97762 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
rp9P97762 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms