Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pitx2P97474 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms