Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Mesp1P97309 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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