Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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SgcdP82347 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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