Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms