Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9xP70398 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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