Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeboxP70368 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms