Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hoxd13P70217 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hoxd13P70217 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hoxd13P70217 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd13P70217 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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