Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf5P70191 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms